野生二粒小麦SBE基因家族鉴定及表达分析

冯政凯, 杨晓莹, 徐晓敏, 黄晨曦, 宋思源, 丁旭, 朱李亚, 熊辉, 陈春环, 赵继新, 王长有, 李停栋, 邓平川, 吉万全

麦类作物学报 ›› 2025, Vol. 45 ›› Issue (07) : 913-921.

野生二粒小麦SBE基因家族鉴定及表达分析

  • 冯政凯, 杨晓莹, 徐晓敏, 黄晨曦, 宋思源, 丁旭, 朱李亚, 熊辉, 陈春环, 赵继新, 王长有, 李停栋, 邓平川, 吉万全
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摘要

淀粉分支酶是参与植株淀粉生物合成和代谢的关键酶之一。为了探究野生二粒小麦淀粉分支酶的功能,利用野生二粒小麦基因组数据,鉴定到9个淀粉分支酶(SBE)基因,并对其理化性质、系统发育、顺式作用元件、共线性和表达模式进行了系统分析。结果表明,9个TdSBEs基因编码的蛋白分子量介于65 518.04~151 934.40 Da,等电点范围为5.37~6.64,亚细胞均定位于叶绿体。经系统进化分析,9个TdSBEs基因可划分为3个亚家族(TdSBEⅠ、TdSBEⅡ和TdSBEⅢ),同一亚家族内不同成员间具有高度相似的基因结构和motif组成。通过顺式作用元件分析,TdSBEs基因包含植物激素、植物生长发育和非生物胁迫相关的元件,同时在TdSBE2亚家族中鉴定到与胚乳和根特异性元件。经染色体定位和共线性分析,TdSBEs家族成员主要在第二和第七同源群,并鉴定到一对串联复制基因。经表达特性分析,TdSBEs基因主要在穗和籽粒中高表达,且其表达具有时空特异性。以上结果说明,野生二粒小麦中存在多个TdSBEs基因,且主要在穗和籽粒中表达,在启动子区域有大量与植物生长发育、植物激素以及逆境反应相关的顺式作用元件。

关键词

野生二粒小麦 / 淀粉分支酶 / 生物信息学 / 表达特性

中图分类号

S512.1

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冯政凯, 杨晓莹, 徐晓敏, 黄晨曦, 宋思源, 丁旭, 朱李亚, 熊辉, 陈春环, 赵继新, 王长有, 李停栋, 邓平川, 吉万全. 野生二粒小麦SBE基因家族鉴定及表达分析. 麦类作物学报. 2025, 45(07): 913-921

基金

杨凌种业创新中心重点研发项目(Ylzy-xm-03)

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