企业经营效率评价是企业管理中的重要环节。本文采用数据包络分析方法中的CCR模型，结合烟草商业企业产出指标的主要影响因素，设定了宏观经济数据和企业微观数据两方面的投入指标，对地市级烟草商业企业下辖分支机构的经营效率进行了评价。结果表明，考虑了宏观经济环境影响因素的分析方法具有更强的区分能力，将宏观经济影响指标作为不可控投入指标的NCN-CCR模型比基本CCR模型更可靠。同时，评价得分可以作为目标责任单位经营业绩考核的依据，这种综合效率评价方法可以保证企业经营效率考核的公平合理性。