为分析叠交地铁施工中既有隧道变形的影响因素，依托苏州市轨道交通S1线工程S1-TS-05标段，针对在砂质淤泥质土层中盾构上穿施工导致的既有隧道的沉降与变形，采用数值模拟方法分析隧道几何参数、空间位置、地层参数等因素对既有隧道的影响，结合现场监测验证数值计算的准确性。研究结果表明：在砂质淤泥质土层盾构上穿施工中，既有隧道的位移和管片变形以竖向沉降为主，且沉降量随着盾构直径的增大而增大，随着覆土层厚度、新旧隧道净距、下穿角度，以及地层弹性模量的增大而减小。现场监测数据与模拟结果较为吻合，既有隧道位移与距叠交中心距离呈负相关关系。研究结论可为同类型地层条件下叠交地铁隧道盾构施工变形控制提供参考。