斑玉蕈子实体转录组测序及解析

王伟霞, 陈源, 童小嫣, 王源, 李欣怡, 李心妍, 陈金日, 吴少杰, 李福后

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江苏海洋大学学报(自然科学版) ›› 2024, Vol. 33 ›› Issue (04) : 33-39.

斑玉蕈子实体转录组测序及解析

  • 王伟霞, 陈源, 童小嫣, 王源, 李欣怡, 李心妍, 陈金日, 吴少杰, 李福后
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摘要

利用Illumina技术对斑玉蕈成熟子实体进行转录组测序,经过数据组装和优化评估,共获得38 112个转录本,去冗余后得到16 580个unigene。将unigene序列与Nr, GO, KEGG等数据库进行比对,共有12 655个unigene获得功能注释,占比76.33%。基于GO和KEGG数据库,将获得功能注释的unigene划分为38个和22个功能亚类。在GO分子功能类别中,发现这些unigene主要归类于催化活性、结合及转运活性等,这与香菇、玉木耳等多种食用菌子实体的分子功能类别相类似。在此基础上,挖掘和分析了斑玉蕈采后生理过程的关键基因,发现大量参与呼吸作用、细胞壁降解等代谢途径的关键基因,同时鉴定了166个转录因子,其中锌指蛋白是数量最多的一类转录因子,共78个。研究结果为食用菌采后分子调控提供重要理论支持。

关键词

斑玉蕈 / 转录组测序 / 转录因子

中图分类号

S646

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王伟霞, 陈源, 童小嫣, 王源, 李欣怡, 李心妍, 陈金日, 吴少杰, 李福后. 斑玉蕈子实体转录组测序及解析. 江苏海洋大学学报(自然科学版). 2024, 33(04): 33-39

基金

江苏省高等学校大学生创新创业训练计划项目(SY202311641638005)

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