海洋细菌作为海洋中上层水体中丰度最高的微型生物类群，主导了海洋中的固碳、硫循环、硝化和氨氧化等生物地球化学循环过程。海州湾作为南黄海西端的开放海湾，资源丰富，是江苏省四大渔场之一。目前对海州湾浮游细菌群落的空间分布仍缺乏较为系统的研究。利用高通量测序技术，对海州湾北部、南部及靠近外海的8个站位进行浮游细菌群落结构多样性调查。研究结果表明，海州湾北部的生物多样性与丰富度最高，而外海站位最低。在海州湾海域共发现43个门、373个科，其中红杆菌科（Rhodobacteraceae）、莫拉氏菌科（Moraxellaceae）、黄杆菌科（Flavobacteriaceae）和放线菌科（Actinomarinaceae）是海州湾海域的主要优势科。基于Bray-Curtis距离的β多样性分析显示海州湾南部和北部的细菌群落结构差异显著，通过线性判别分析（linear discriminant analysis effect size, LEfSe）共找出172个差异分类单元。进一步分析发现，环境因子差异显著影响海州湾区域的细菌群落组成，其中温度、pH和NH₄⁺-N直接或间接地影响细菌生长代谢进而影响海州湾细菌的群落结构组成。