为了筛选低温胁迫下拟南芥核心差异表达基因和相关的代谢通路，通过检索GEO数据库中与拟南芥低温胁迫相关的芯片数据集，并利用GEO中的GEO2R工具筛选差异基因，然后利用DAVID数据库对筛选后的差异表达基因进行GO富集和KEGG富集注释，再结合STRING数据库对差异表达基因构建蛋白质互作关系网络图。研究结果表明：确定芯片GSE106635中的GSM2844128、 GSM2844129、GSM2844132和GSM2844133样本为研究对象，筛选出788个差异表达基因，其中491个上调差异表达基因，297个下调差异表达基因；通过DAVID在线功能富集分析可知，低温胁迫主要对拟南芥体内的蛋白质激酶活性和蛋白质结合有显著影响。挖掘出CCA1、LHY、LTI78、COR15A、SUS1、COR47、PRR5、GI、ABA1、LEA14等在低温逆境中起关键作用的核心差异表达基因。