本研究旨在揭示基础日粮中不同浓度的卷丹百合珠芽对藏猪卵巢卵泡发育及相关LncRNA表达的影响。将同一批次健康的体重为（17.40±1.15）kg的9头雌性西藏藏猪，随机分为BW组（基础日粮）、BY组（基础日粮+1%百合珠芽）和BR组（基础日粮+2%百合珠芽），饲喂6周后，利用石蜡切片HE染色观察卵巢形态，测定卵巢器官指数和不同类型卵泡数量，并利用高通量测序技术对lncRNA进行转录组测序分析，最后对差异lncRNA进行荧光定量验证。结果显示：（1）卵巢表面与卵泡特征：BR组，藏猪卵巢表面出现大卵泡；卵巢指数，各组间无显著差异；卵泡比例，BW组原始卵泡比例最高，BY组二级卵泡比例最高，BR组成熟卵泡比例最高。（2）lncRNA筛选与表达：新预测lncRNA，筛选出5 772个新预测的lncRNA；表达量分析，BY组平均表达量最高，BW组最低，3组表达趋势相似；组间相关性，BY组、BW组和BR组3个组间相关性较强。（3）差异表达分析：BW＿vs＿BY，筛选到2 021个差异表达lncRNA基因（BY组相对BW组上调1 197个，下调824个）；BW＿vs＿BR，筛选到1 308个差异表达lncRNA基因（BR组相对BW组上调829个，下调479个）；BY＿vs＿BR，筛选到1 330个差异表达lncRNA基因（BR组相对BY组上调646个，下调684个）。（4）lncRNA靶基因预测与功能分析：靶基因预测，预测得到CCNL2、MAP3K14、STUB1、IQANK1和PKP3；靶基因GO和KEGG富集分析，发现c AMP、MAPK、PI3K-Akt、Wnt等与卵巢发育信号相关的通路都被显著富集到，其中相关信号通路的基因有LOC110261342、MSTRG.26467、FXN、CLP1、Gem、PODNL1、TGFBR3L等。结果表明，在饲料中添加百合珠芽（特别是2%浓度）有助于促进藏猪卵巢成熟卵泡的发育，并显著调控lncRNA表达，参与卵巢发育的多条生物学通路，为进一步理解百合珠芽对藏猪生殖能力的提升提供了基础数据和理论支持。