黑青稞花青素调控H9C2心肌细胞miRNA表达谱的生物信息学分析

舒森彪, 李昭华, 李思敏, 李梁, 刘振东

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高原农业 ›› 2025, Vol. 9 ›› Issue (02) : 183-198. DOI: 10.19707/j.cnki.jpa.2025.02.005

黑青稞花青素调控H9C2心肌细胞miRNA表达谱的生物信息学分析

  • 舒森彪, 李昭华, 李思敏, 李梁, 刘振东
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摘要

探讨黑青稞花青素对H9C2心肌细胞miRNA表达谱的影响,研究黑青稞花青素通过调控miRNA来实现对心肌细胞保护的潜在机制。设置6组不同处理的H9C26细胞,分别为正常组(CK)、过氧化氢组(H2O2)、黑青稞花青素组(ACN)、原花青素组(OPC)、黑青稞花青素+过氧化氢组(ACN+H2O2)、原花青素组+过氧化氢组(OPC+H2O2),处理后提取各组细胞总RNA进行miRNA测序,对测序数据进行生物信息学分析。发现H2O2组和CK组比较,H2O2处理H9C2后导致469个miRNA上调,133个miRNA下调;H2O2组和ACN+H2O2组比较,H2O2致273个miRNA上调,214个miRNA下调;H2O2组和OPC+H2O2组比较,H2O2致330个miRNA上调,222个miRNA下调;ACN和CK组比较,88个miRNA上调,25个miRNA下调;OPC和CK组比较,88个miRNA上调,27个miRNA下调;这些结果表明花青素预处理可通过调节miRNA缓解H2O2带来的影响。KEGG富集分析及差异表达miRNA的靶基因预测和富集分析结果显示,黑青稞花青素通过调控mTOR、PI3K/Akt/mTOR、MAPK等信号通路及上调miR-21等miRNA的表达,发挥抗氧化和抗凋亡作用。本研究可为黑青稞花青素预防和治疗心血管疾病提供一定的依据。

关键词

黑青稞花青素 / 心血管疾病 / miR-21 / miRNA / 生物信息学分析

中图分类号

TS201.4 / TS264.4

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舒森彪, 李昭华, 李思敏, 李梁, 刘振东. 黑青稞花青素调控H9C2心肌细胞miRNA表达谱的生物信息学分析. 高原农业. 2025, 9(02): 183-198 https://doi.org/10.19707/j.cnki.jpa.2025.02.005

基金

西藏自治区自然科学基金项目(XZ202101ZR0027G)

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