为了探讨不同饲喂方式与不同肠段间藏猪细菌群落组成的差异性，部分阐明藏猪肠道微生物的特异性。选用两年龄的放牧与舍饲藏猪各3头，分别采集盲肠与结肠食糜样品，测定细菌16S rRNA基因的V3-V4区域，分析细菌群落的组成，探讨盲肠与结肠细菌群落的空间差异格局；采用Person相关性分析探索盲肠与结肠细菌群落的相关性。结果表明，不同饲养方式下，在门水平细菌群落分别有4个差异分类单元，在属水平盲肠中有19个差异分类单元、结肠中有9个差异分类单元。不同饲养方式下，藏猪细菌群落的Beta多样性表现出明显的差异性。在放牧养殖条件下，藏猪的盲肠食糜中拟杆菌门、变形菌门和TM7的相对丰度显著高于结肠（P<0.05），厚壁菌门、螺旋体门、放线菌门、软壁菌门与疣微菌门相对丰度两个肠段间无显著差异（P>0.05）。放牧藏猪盲肠中Unclassified＿Ruminococcaceae（厚壁菌门、瘤胃球菌科）、Unclassified＿Clostridiales（厚壁菌门、梭菌目）、Unclassified＿Bacteroidales（拟杆菌门、拟杆菌目）、Turicibacter（厚壁菌门、苏黎世杆菌科）与梭菌属（厚壁菌门、梭菌科）相对丰度显著高于结肠（P<0.05），但链球菌属（厚壁菌门、链球菌科）相对丰度显著低于结肠（P<0.05）。舍饲藏猪盲肠与结肠间细菌群落无显著差异（P>0.05）。放牧藏猪盲肠与结肠中细菌群落关联网络中各节点联系较为紧密，彼此间呈现竞争或者协同作用，舍饲藏猪盲肠与结肠细菌群落关联网络中各节点联系较为松散。结果说明，饲养方式影响藏猪肠道中细菌群落的组成，放牧养殖条件下藏猪肠道细菌表现出更加多元的状态。