聚球藻XM24中发现疑似为硅酸转运子的基因

韩雅波, 孙军

地球科学 ›› 2025, Vol. 50 ›› Issue (06) : 2444-2451.

聚球藻XM24中发现疑似为硅酸转运子的基因

  • 韩雅波, 孙军
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摘要

硅是硅藻所必需的营养物质.硅藻可以通过硅酸转运子(Silicon Transporter,SIT)蛋白吸收环境中的溶解硅,在全球海洋的硅循环中起着重要作用.海洋单细胞聚球藻(Synechococcus)也被发现可以进行硅的累积作用.由于聚球藻进化出现的时间远远早于硅藻,推测也可以像硅藻一样通过SIT这样的转运蛋白来吸收海洋中的溶解硅.本研究在有硅和无硅两种条件下探究聚球藻中SIT存在的可能性,最终找到2条疑似为SIT基因序列,并成功预测得到其蛋白质序列及功能,结果显示均与膜转运过程有关.最终利用AutoDock4软件成功预测到蛋白质的活性位点.

关键词

SIT基因 / 聚球藻 / 宏转录组 / 蛋白质预测 / 分子对接模拟 / 海洋生物学

中图分类号

Q943

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韩雅波, 孙军. 聚球藻XM24中发现疑似为硅酸转运子的基因. 地球科学. 2025, 50(06): 2444-2451

基金

国家重点研发计划项目(No.2019YFC1407800); 国家自然科学基金项目(Nos.41876134,41676112); 教育部长江学者奖励计划(No.T2014253)

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