黄素类还原酶（FMN还原酶）是微生物分泌电子穿梭体引导铁氧化还原的重要酶.为探讨FMN还原酶基因作为铁循环微生物指示物的可行性，以汉江下游河水-地下水交互带为研究区，研究了3个不同特点的河水-地下水交互带剖面沉积物中不同价态Fe浓度、代表性铁循环微生物和FMN还原酶基因相对丰度的分布相关性.结果表明：（1）在离河较近的地下水位以下区域聚积Fe(Ⅱ)，而Fe(Ⅲ)主要聚集在地下水位线上或离河较远的区域；（2）铁循环微生物和FMN还原酶主要分布在近河岸地下水位线下的区域或水位线的周围，不同的铁循环微生物聚集的区域不同；（3）铁循环微生物总丰度ICB与FMN还原酶基因呈现出极显著的正相关.该研究结果表明FMN还原酶基因可以作为交互带铁循环的微生物指示物.