基于BERT和集成学习的抗菌肽预测

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电子科技大学学报 ›› 2024, Vol. 53 ›› Issue (04) : 635-640.

基于BERT和集成学习的抗菌肽预测

高皖陵, 赵俊, 岳振宇

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摘要

利用计算方法准确识别抗菌肽是近年来生物信息学领域研究的重点问题。传统的机器学习方法需要自主从序列信息中提取和选择特征，导致抗菌肽识别准确率低。为此提出基于BERT的深度学习预测方法，从预训练策略、词向量嵌入、预测性能等方面比较了4种现有基于BERT的抗菌肽预测模型，并基于集成学习思想提出了一个新的抗菌肽预测工具。实验结果表明，该模型在多个性能评价指标上都有所提升。