基于全局图注意力元路径异构网络的药物-疾病关联预测

郁湧, 杨雨洁, 李虓晗, 高悦, 于倩

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电子科技大学学报 ›› 2024, Vol. 53 ›› Issue (04) : 576-583.

基于全局图注意力元路径异构网络的药物-疾病关联预测

  • 郁湧, 杨雨洁, 李虓晗, 高悦, 于倩
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摘要

提出了一个基于全局图注意力元路径异构网络模型(MHNGA)来进行药物-疾病关联预测。首先,收集整理药物和疾病数据,将已知的药物-疾病关联、药物相似性、疾病相似性构建为一个异构网络;其次,引入多个基于元路径的子图,使用图注意力神经网络提取这些子图的邻居节点的特征,并且通过通道注意力和空间注意力机制来增强特征;最后,通过十折交叉验证的评估,MHNGA取得了93.5%的精确召回曲线下的面积和99.4%的准确率。

关键词

异构图 / 药物-疾病关联 / 预测 / 图注意力神经网络 / 元路径

中图分类号

R9 / TP18

引用本文

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郁湧, 杨雨洁, 李虓晗, 高悦, 于倩. 基于全局图注意力元路径异构网络的药物-疾病关联预测. 电子科技大学学报. 2024, 53(04): 576-583

基金

国家自然科学基金(62366058); 云南省科技厅面上项目(202001BB050063); 云南省软件工程重点实验室开放项目(2020SE315)

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