数据采集系统是数字示波器（DSO）的核心组成单元，随着示波器带宽采样率的逐步提升，单片模数转换器（ADC）+现场可编辑门控阵列（FPGA）的架构难以满足超高速以及多通道的应用场景，因此，高端示波器中数据采集系统普遍采用“主从”FPGA控制架构。在该架构下，多个FPGA之间信号的同步传输是实现采集系统的同步和精确采集的重要前提。针对多FPGA板卡之间的信号同步传输问题，提出了一种FPGA之间高速信号同步传输的方法，借助FPGA的IODELAY单元，通过测试数据训练找到最稳定的同步传输区间，实现多FPGA之间的同步传输。在自研的数字示波器上的实验表明，该方法能够有效实现FPGA之间高速信号的同步传输。