调节水体营养平衡是控制富营养化水体碳、氮、磷营养负荷及恢复水体生态系统的重要手段。从微生物、水生植物和水生动物三方面剖析了基于营养平衡调控的水体生态修复机理。着重介绍了基于营养平衡调控的工程修复方法(生态浮岛，沉水植物，人工湿地，微生物修复)的原理、优缺点及改良方法。生态浮岛易受水生植物的根茎长度及系统碳源的限制，可悬浮复合填料或提供还原态无机物作为电子供体替代有机碳源；将水生动物、微生物与沉水植物结合可提高沉水植物修复法的环境适应性；人工湿地存在碳氧水平和基质碳源不足的问题，可通过增氧和向基质添加天然有机物质、无机底物等方法解决；微生物修复受到的限制因素较少。未来可在工程应用中组合使用上述修复方法，从而构建多级水生态平衡系统。