为探究新疆托木尔峰不同植物根际土壤真菌群落结构和功能差异，利用高通量测序技术探究该保护区内野党参、早熟禾、老鹳草、紫花苜蓿4种植物根际土壤真菌群落结构差异，并分析不同植物根际土壤理化特性与真菌群落结构之间的相关性。结果表明，野党参根际土壤真菌的Shannon和Simpson指数显著高于老鹳草(P<0.05)，但与早熟禾差异不显著。非度量多维尺度分析(non-metric multidimensional scaling,NMDS)结果表明，早熟禾根际土壤真菌群落与老鹳草、紫花苜蓿的差异性相对较小，而早熟禾、老鹳草、紫花苜蓿三者的根际土壤真菌群落与野党参的差异性相对较大。4种植物根际土壤的优势真菌门为子囊菌门、被孢霉门、担子菌门和壶菌门，而被孢霉目、肉座菌目是其优势菌目，但它们在不同植物中的相对丰度不尽相同。从营养类型看，4种植物根际土壤真菌优势营养模式均以腐生营养型为主，其相对丰度占32.1%～52.5%，第二优势营养型在野党参和老鹳草根际土壤中分别是共生营养型(9.3%)和病理腐生过渡型(4.1%)，在早熟禾和紫花苜蓿中是病理营养型(8.3%和15.8%)。从功能类群看，未定义腐生真菌是4种植物的最优势功能菌群，其相对丰度占28.6%～44.2%，而其他功能群在不同植物中的占比各不相同。由此可见，托木尔峰根际土壤真菌群落结构在不同植物物种间有差异，研究结果可为深入理解山地植物的环境适应策略和该地区生态环境修复提供理论依据。