紫花苜蓿LACS基因家族成员鉴定及表达分析

罗天蓉, 马健芝, 杜明阳, 多杰措, 熊辉岩, 段瑞君

草业学报 ›› 2025, Vol. 34 ›› Issue (04) : 124-136.

紫花苜蓿LACS基因家族成员鉴定及表达分析

  • 罗天蓉, 马健芝, 杜明阳, 多杰措, 熊辉岩, 段瑞君
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摘要

长链脂酰辅酶A合成酶(LACS)基因家族是包含在酰基激活酶超家族中的一类,在脂肪酸合成代谢中具有重要的作用。基于紫花苜蓿基因组数据,采用生物信息学方法对紫花苜蓿LACS基因家族成员进行鉴定,构建系统发育树,进行理化性质、染色体定位、保守基序和基因结构、顺式作用原件及组织特异性表达分析,然后构建蛋白互作网络分析,通过qRT-PCR试验进行非生物胁迫表达分析。结果表明:在紫花苜蓿基因组中共鉴定得到10个MsLACS家族成员,分别位于5条染色体上;通过构建系统发育树,将MsLACS分为5支;保守基序分析发现12个不同的保守基序,Motif3构成了AMP保守结构域,MsLACS基因均含10~12个基序不等;基因结构分析发现,MsLACS基因结构大有不同,MsLACS基因的外显子数量为11~22个,所含内含子数量为0~3个不等,MsLACS1-1和MsLACS3不含内含子;MsLACS基因的启动子区域中主要有光反应元件、激素反应元件和非生物胁迫反应元件等;MsLACS基因在不同组织中表达不同,且具有明显的组织特异性;非生物胁迫表达分析表明:紫花苜蓿MsLACS基因对于干旱胁迫和盐胁迫响应水平整体较高,对冷胁迫响应水平偏低,表达量整体呈先升高后降低的起伏型,在叶片组织中偏高,根组织中较低;干旱和盐胁迫下,MsLACS基因在叶片中均高表达,胁迫时间段为6 h时,表达量水平整体达到最高;紫花苜蓿10个MsLACS基因共同互作,各蛋白与其他蛋白互作连线分别有18条,相互间有较强互作。研究结果可为探究紫花苜蓿中LACS基因表达以及胁迫育种提供一定研究基础。

关键词

紫花苜蓿 / 长链脂酰辅酶A合成酶(LACS) / 基因家族 / 非生物胁迫 / 表达

中图分类号

S541.9

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罗天蓉, 马健芝, 杜明阳, 多杰措, 熊辉岩, 段瑞君. 紫花苜蓿LACS基因家族成员鉴定及表达分析. 草业学报. 2025, 34(04): 124-136

基金

青海省重点研发与转化计划(2022-NK-135); 青海省高原紫花苜蓿品种适应性评价与示范资助

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