【目的】本研究旨在获得棋楠沉香钻孔结香适用距离，并探索其结香质量，为棋楠沉香的优质高效生产以及应用提供指导。【方法】采用不同距离钻孔诱导棋楠木结香，即4 cm(FW)、8 cm(EW)和16 cm(SW)。处理12个月后分析棋楠所结沉香的醇溶性提取物含量（质量分数）、精油含量（质量分数）以及显色反应。通过气相色谱–质谱联用仪（GC-MS）分析沉香中的挥发性特征化学成分，即倍半萜类和2-(2-苯乙基)色酮（PECs），并进一步通过高效液相色谱–质谱联用仪（HPLC-MS）分析沉香中非挥发性的PECs。【结果】（1）FW、EW和SW处理的沉香醇溶性提取物含量分别为（42.01±1.86）%、（46.60±0.73）%和（42.54±2.15）%，精油含量分别为（37.47±1.45）%、（40.47±0.91）%和（37.33±1.14）%。（2）棋楠沉香样品的显色反应表现为紫色、樱桃红和紫红色，其理化显色反应均符合《中华人民共和国药典》要求。（3）共鉴定出40种挥发性特征化学成分，其中FW、EW、SW处理下倍半萜与PECs的数量之和分别为36、38和38种，相对含量之和分别达86.63%、91.89%和79.10%。（4）共鉴定出62种非挥发性PECs，其中双环氧2-(2-苯乙基)色酮（DEPECs）、单环氧2-(2-苯乙基)色酮（EPECs）、四氢2-(2-苯乙基)色酮（THPECs）和flidersia类型2-(2-苯乙基)色酮（FTPECs）分别有5、6、3和48种，并详细解析了这4种色酮类型的裂解规律，通过代谢组学分析，成功地将来自不同钻孔距离（EW、FW的处理组合（E-FW组）与SW组）的样品进行了有效区分。【结论】钻孔诱导处理在棋楠结香的诱导中展现出高效性，尤其是EW处理对棋楠树种的适组用性更为突出，这一创新方法不仅显著提升了结香效率，还大幅缩短了所需时间，从而实现了沉香产量和质量的双重提升，具有广阔的应用前景。