目的：探索北京市中小学生青春发动时相与心血管代谢危险因素的相关性及存在的性别差异。方法：分层整群抽取3 067名来自北京市房山区16所中小学校的学生，对其进行问卷调查、体格检查和血清实验室检测，采用多分类多因素Logistic回归模型分析中小学生青春发动时相与心血管代谢危险因素的相关性。结果：男生青春发动时相提前和延迟检出率分别为14.73%和9.46%,女生为12.89%和10.99%。学生中心性肥胖、高血压、高血糖和血脂异常检出率分别为35.87%、19.95%、2.54%和26.31%,心血管代谢危险因素聚集1项、2项和3项及以上的检出率分别为29.21%、16.17%和9.36%。调整学段、地区、出生体质量、喂养方式、是否独生子女、父母最高文化程度和家庭月收入后，相较于青春发动适时组，青春发动提前组女生发生1个危险因素聚集、2个危险因素聚集和3个及以上危险因素聚集的风险分别提高1.94倍(95%CI=1.29～2.91)、2.97倍(95%CI=1.89～4.67)和2.02倍(95%CI=1.13～3.63);男生青春发动时相与心血管代谢危险因素聚集的相关性无统计学意义(P>0.05)。结论：青春发动时相提前是女生心血管代谢危险因素聚集的独立危险因素，应实施一级预防策略以减轻人群心血管代谢疾病负担。